ATAC-seq (染色质可及性测序)

 

ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin sequencing)是目前染色质构象研究的主流工具。其原理是,通过Tn5转座酶在细胞核内的染色质DNA上进行随机转座:开放区域的染色质由....

BS-seq (DNA甲基化测序)

 

DNA甲基化和去甲基化的动态平衡控制着生物体中基因表达的强度。甲基化可以改变DNA片段的活性,当位于基因启动子中时,DNA甲基化通常起到抑制基因转录的作用。在哺乳动物中,DNA甲基化对于正常发育...

G4-ChIP-seq·G-四链体染色质免疫共沉淀测序

 

染色质结构和状态与基因表达和DNA复制以及表观遗传调控密切相关,尽管转录因子、染色质相关蛋白、组蛋白修饰和DNA甲基化等已经被广泛研究,但是DNA二级结构也具有调控功能。在所有DNA二级结构中...

6mA DIP-seq

 

N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,简写为6mA或m6dA)是一类很长一段时间被忽略的DNA甲基化修饰,过去认为6mA仅存在于原核生物DNA中,是一种用于保护DNA免受噬菌体感染或其他外源性攻击的防御机制...

RRBS(简化甲基化测序)

 

简化甲基化测序(RRBS, Reduced Representation Bisulfite Sequencing)是一种准确且具有高性价比的DNA甲基化研究方法,在大规模临床样本研究中被广泛应用。RRBS利用限制性内切酶对基因组进行酶切...

5mC DIP-seq

 

5mC DIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用免疫共沉淀测序技术,通过特异性抗体富集基因组上发生5mC甲基化的DNA片段,再利用高通量测序,可以在全基因组水平上进行高精度5mC甲基化区域研究...

4acC DIP-seq

 

N4-胞嘧啶乙酰化(N4-acetyldeoxycytosine ,4acC)是近年在植物和哺乳动物中被关注的一种DNA修饰类型。类似于5mC等修饰,4acC修饰也是一种DNA碱基的氧化修饰形式,其生成通常涉及氧化酶的催化作用...

5hmC DIP-seq

 

DNA甲基化和羟甲基化是基因表达调控的重要表观遗传修饰。 5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)由5-甲基胞嘧啶(5mC)被TETs家族双加氧酶转化而来,是一种发生在胞嘧啶上并影响基因表达的DNA修饰形式...