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转录组学>
转录组学是通过特定分子生物学技术富集组织/细胞内不同类型的RNA分子,结合高通量测序技术,对不同类型RNA的表达,以及在生物学过程中的变化进行研究的组学技术。
根据研究的RNA对象的不同,转录组学包含以下测序产品:
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免疫组学>
免疫组库是指体内B细胞和T细胞受体的总和。在感染、疾病发生或生理状态发生变化时,体内抗原/配体的种类、数量发生变化,会导致T/B细胞受体的种类、数量发生相应变化。
因此对T/B细胞免疫组库的研究,有助于增强我们感染、疾病等生物学过程中免疫细胞应答机制的研究。
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Digital RNA
优势:
1)去重:去除PCR和测序重复,还原最真实的样本中重复
2)纠错:纠正PCR扩增和测序带来的碱基错误
3)基于上述两点,对于低起始量样品,可适量增加循环数,提高建库、上机测序成功率。同时避免PCR偏好带来的干扰
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T/BCR-seq
康测开发出“绝对定量TCR/BCR-seq”测序技术,其原理为在扩增偏好性更低的5' RACE技术基础上,引入我公司UMI/UID数字标签纠错技术,以解决建库测序过程中PCR重复引入的定量准确性问题和PCR/测序扩增引入的假阳性TCR问题。其原理如图所示:
该技术具备以下优势
• 完整TCR/BCR检测:该技术使用5’RACE技术原理,可以获得TCR/BCR的完整序列,全面研究CDR1/2对抗原的亲和力影响;
• PCR偏好性低:该技术使用5’RACE技术原理,相较于多重PCR具有更低的偏好性;
• 定量准确:通过引入UMI数字标签,进一步去除PCR扩增重复和测序重复、彻底排除重复引入的定量问题,准确还原TCR/BCR克隆的丰度;
• 无假阳性:通过引入UMI数字标签,多序列比对校正PCR和测序错误,去除假阳性TCR/BCR;
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DSN-seq
康测科技开发的DSN RNA seq解决了传统rRNA剔除RNA seq的物种依赖性的局限性。其原理是通过对双链cDNA的变性和重新退火,再使用DSN酶特异性消化双链DNA。在这一过程中,由于rRNA的丰度较高,优先退火形成双链cDNA,而被DSN酶消解去除。
DSN RNA seq在互作RNA seq,尤其是多物种互作转录组中表现出优异的性能。它可以一次性、并行去除原核和真核生物的所有rRNA,从而使得所有类型的宿主-病原体dual RNA-seq研究成为可能。
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核酸自动化平台
目前康测科技还配备了RNA提取、建库、pooling全流程自动化工作站,单次可以制备96个高均一性RNA seq文库,提高效率的同时,可最大限度的保持实验的一致性和稳定性,消除批次效应和交叉污染,保障了项目的质量和真实性。
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免疫沉淀自动化体系优势介绍
免疫沉淀自动化体系主要针对于实验中的孵育,多次洗涤,产物洗脱等过程全程采用自动化仪器执行。基于自动化的磁吸装置,以转移磁珠替代传统人工转移反应液的方式,避免操作差异对的IP效率的干扰。
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喜讯连连!上周发表1篇ACS Nano、1篇Nature Communications、1篇Cell子刊...
上周康测科技助力四川大学华西医院、四川大学、山东大学客户成功发表文章,分别刊登在ACS Nano(IF 15.8)、Nature Communications(IF 14.7)、Cell Reports(IF 7.5)期刊上。
넶23 2025-01-14
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