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      NEW

      表观遗传调控,包括染色体结构、染色质可及性、组蛋白修饰,以及DNA修饰等,是最重要的基因表达调控方式之一。表观遗传组学就是通过特定分子生物学技术和高通量测序结合,对上述表观遗传修饰的分布、在生物学过程中的变化等进行研究的组学技术。

       

      常见的研究工具包括:

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      • m6A meRIP-seq
      • m5C meRIP-seq
      • m5C bsRNA-seq
      • ac4C acRIP-seq
      • m7G meRIP-seq

      RNA修饰目前已经发现100多种,大部分发生在rRNA和tRNA上。近期研究发现多种修饰发生在mRNA和lncRNA上,全面参与RNA的结构、转运、稳定性和 mRNA 剪接等过程,是基因表达转录后调控的重要方式之一。

       

      大部分修饰缺乏研究工具,由于化学转化和抗体技术的发展,目前有多种修饰有了测序研究工具:

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    • Digital RNA-seq
    • T/BCR-seq
    • DSN-seq
    • Digital RNA      

       

       

      优势:

      1)去重:去除PCR和测序重复,还原最真实的样本中重复

      2)纠错:纠正PCR扩增和测序带来的碱基错误

      3)基于上述两点,对于低起始量样品,可适量增加循环数,提高建库、上机测序成功率。同时避免PCR偏好带来的干扰

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    • T/BCR-seq   

       

      康测开发出“绝对定量TCR/BCR-seq”测序技术,其原理为在扩增偏好性更低的5' RACE技术基础上,引入我公司UMI/UID数字标签纠错技术,以解决建库测序过程中PCR重复引入的定量准确性问题和PCR/测序扩增引入的假阳性TCR问题。其原理如图所示:

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      该技术具备以下优势

      • 完整TCR/BCR检测:该技术使用5’RACE技术原理,可以获得TCR/BCR的完整序列,全面研究CDR1/2对抗原的亲和力影响;

      • PCR偏好性低:该技术使用5’RACE技术原理,相较于多重PCR具有更低的偏好性;

      • 定量准确:通过引入UMI数字标签,进一步去除PCR扩增重复和测序重复、彻底排除重复引入的定量问题,准确还原TCR/BCR克隆的丰度;

      • 无假阳性:通过引入UMI数字标签,多序列比对校正PCR和测序错误,去除假阳性TCR/BCR;

    • DSN-seq     

       

       

      康测科技开发的DSN RNA seq解决了传统rRNA剔除RNA seq的物种依赖性的局限性。其原理是通过对双链cDNA的变性和重新退火,再使用DSN酶特异性消化双链DNA。在这一过程中,由于rRNA的丰度较高,优先退火形成双链cDNA,而被DSN酶消解去除。        

      DSN RNA seq在互作RNA seq,尤其是多物种互作转录组中表现出优异的性能。它可以一次性、并行去除原核和真核生物的所有rRNA,从而使得所有类型的宿主-病原体dual RNA-seq研究成为可能。

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    • 核酸自动化平台
    • 免疫共沉淀自动化平台
    • 核酸自动化平台

       

       

      目前康测科技还配备了RNA提取、建库、pooling全流程自动化工作站,单次可以制备96个高均一性RNA seq文库,提高效率的同时,可最大限度的保持实验的一致性和稳定性,消除批次效应和交叉污染,保障了项目的质量和真实性。

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    • 免疫沉淀自动化体系优势介绍

       

       

      免疫沉淀自动化体系主要针对于实验中的孵育,多次洗涤,产物洗脱等过程全程采用自动化仪器执行。基于自动化的磁吸装置,以转移磁珠替代传统人工转移反应液的方式,避免操作差异对的IP效率的干扰。

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  • 产品服务
  • 核心技术
  • 创新平台

丰富的产品线,项目数10000+

提供领先的绝对定量RNA测序技术和表观、互作研究技术服务

 

  • 合作成果
  • 合作成果
    • 喜讯连连!上周发表1篇ACS Nano、1篇Nature Communications、1篇Cell子刊...

      上周康测科技助力四川大学华西医院、四川大学、山东大学客户成功发表文章,分别刊登在ACS Nano(IF 15.8)、Nature Communications(IF 14.7)、Cell Reports(IF 7.5)期刊上。

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    • 样本量少!分选细胞!全血!康测科技2024年高分免疫组学文章盘点

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