康测科技临床样本的三代测序,N50达1.68kb

 

 

三代DRS测序凭借直接对单条RNA分子进行测序、无需PCR扩增、长读长等特点,在表观遗传修饰(如m6A、m5C等)鉴定方面应用颇多。临床样本因离体后未及时固定或冷冻、内源性RNase活性高等原因,容易导致RNA降解(表现为低RQN值),致使文库质量不高,而三代测序对于RNA的完整性要求较高,对于临床样本存在挑战。

 

近期,面对RIN值分布在7左右的临床样本,康测科技对临床样本的DRS建库进行了针对性优化,建库成功的同时获得了较好的测序数据,我们一起来看看吧!

 

 

 

 

 

结果展示

 

Reads读长指标N50:本项目长度达到1.68 kb(下图),与文献报道[1]的人细胞RIN值9以上的N50相当甚至更好(下表)。

 

 

 

数据质量:大部分数据的Q Score值落在10-15,说明测序质量较好。

 

 

 

康测科技凭借在各类复杂样本中积累的丰富项目经验,根据项目情况适当调整实验流程,为客户提供更优质的研究结果与服务体验!

 

 

 

参考文献

[1] Yair D J Prawer, Josie Gleeson, Ricardo De Paoli-Iseppi, Michael B Clark. Pervasive effects of RNA degradation on Nanopore direct RNA sequencing[J]. NAR Genomics and Bioinformatics,  2023.

 

 

 

 

 

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关于康测

 

康测致力于先进组学技术的开发和在生物医学研究领域的应用,建立了涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、表观转录组学、免疫组学和互作组学的全面组学服务体系。而在医学检测方面,康测基于自主研发的SMP(Stranded Multiplex PCR)靶向测序技术,可提供检测灵敏度和特异性均为100%的MRD一站式自动化解决方案。

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创建时间:2025-02-24