康测科技DAP-seq助力湖南农大武涛教授团队揭示CsMYB36调节黄瓜腺毛中细胞分化机制

 

 
 
 

快速导读

 
 
 

 

 
 
 
 
 

【题目】CsMYB36-mediated ROS homeostasis modulates the switch from cell division to differentiation in cucumber glandular trichome

【发表期刊】The Plant Journal

【发表时间】2025年2月24日

【IF】6.2

【发表单位】湖南农业大学

【康测科技提供技术】DAP-seq

 
 
 
 
 

 

黄瓜中GT发育阶段

CsMYB36介导ROS稳态以平衡GT细胞分裂和细胞分化的模型

植物腺毛（GT）可以合成、储存和分泌各种特殊代谢物，保护植物对抗生物和非生物胁迫。黄瓜（Cucumis sativus L.）是世界范围内最重要的蔬菜作物之一。蜡粉（白色粉状物），由GT产生，不仅影响外观质量和最终市场价值，还赋予黄瓜对病原体的抵抗力以及防止水分流失。GT的形成需要经过一系列细胞分化事件，这一过程对特殊化合物（如蜡粉）的产生至关重要。然而，黄瓜GT发育过程响应环境调控的分子机制尚不清楚。
 
2025年2月24日，湖南农业大学武涛教授团队在The Plant Journal上发表了题为“CsMYB36-mediated ROS homeostasis modulates the switch from cell division to differentiation in cucumber glandular trichome”的研究文章，揭示了CsMYB36在调节活性氧（ROS）稳态和黄瓜GT细胞分化中的作用机制。研究表明，CsMYB36和CsGL1形成一个正反馈回路调节黄瓜GT中细胞分裂到细胞分化的转换。联合DAP-seq和RNA-seq，研究发现CsMYB36/CsGL1可以调节苯丙氨酸合成相关基因的表达，包括过氧化物酶53（CsPRX53），这是一种ROS清除酶。此外，H2O2有效抑制Csmyb36突变株中GT细胞分裂。总之，研究揭示CsMYB36协同CsGL1通过介导ROS稳态来平衡黄瓜GT中的细胞分裂和分化，影响GT模式以及蜡粉形成。

 

 

研究思路

 

 

关键结果展示

 

康测科技为本研究提供DAP-seq技术服务，检测CsMYB36调节的靶基因。在2个生物学重复中鉴定到27012个重叠的CsMYB36结合位点。并且，这些CsMYB36结合位点在启动子区域高度富集（16168个peak，占比59.85%）。进一步联合DAP-seq和RNA-seq（WT与ygp突变株的果皮，DEG）分析以鉴定受CsMYB36调节且与GT发育相关的基因，共鉴定到323个重叠基因。其中，284个基因的启动子区域存在CsMYB36结合。KEGG分析表明植物激素信号转导和苯丙烷代谢通路被富集。此外，将上述284个受CsMYB36调节的、果皮发育相关的靶基因与CsGL1调节的GT发育相关基因（gl1突变株与对照植株的叶的RNA-seq，DEG）取交集以鉴定CsMYB36和CsGL1的共调控基因，共鉴定到100个重叠基因。PEROXI-DASE53（CsPRX53）（CsaV3_4G023640）被CsMYB36和CsGL1共调控，DAP-seq显示CsMYB36结合CsPRX53的启动子区域。酵母单杂交证实CsMYB36 可以直接结合CsPRX53的启动子。总之，DAP-seq为鉴定CsMYB36结合靶基因，进而阐明CsMYB36影响黄瓜GT模式的分子机制提供助力。

 

 

参考文献

 

Chunhua Wang, Hongxin Yao, Kai Fang, et al. CsMYB36-mediated ROS homeostasis modulates the switch from cell division to differentiation in cucumber glandular trichome[J]. The Plant Journal, 2025

 

 

热点推荐

 
 

 

 

点个“在看”再走呗（右下角）

 

 

 

 

 

更多平台

 

bilibili

（长干货科普）

 

视频号

（产品知识分享）

 

小红书

（短干货科普）

 
 

 

 

 

关于康测

 

康测致力于先进组学技术的开发和在生物医学研究领域的应用，建立了涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、表观转录组学、免疫组学和互作组学的全面组学服务体系。而在医学检测方面，康测基于自主研发的SMP（Stranded Multiplex PCR）靶向测序技术，可提供检测灵敏度和特异性均为100%的MRD一站式自动化解决方案。

康测提供全面的基因表达调控研究工具

康测提供高度自动化MRD一站式解决方案

 

 

 

创建时间：2025-03-06