免疫沉淀实验的痛点
免疫沉淀(IP,Immunoprecipitation)是使用特异性结合抗体将抗原从溶液中沉淀出来的技术。基于研究对象的不同,IP/CoIP可以用于研究目的蛋白相互作用的靶标蛋白或靶标DNA/RNA, 康测科技提供的对应的高通量组学研究技术包含CoIP-MS, ChIP seq和RIPseq等。除蛋白作为抗体识别表位外,研究者关注的具有特定二级结构或者修饰(G4-DNA/m5C/m6A...)的DNA和RNA也可以通过特异性抗体富集并进行测序分析,详情可以查看表观组学中的G4-ChIP seq、meRIP seq、 meDIP等产品介绍。
虽然免疫沉淀的应用非常广泛,但是由于其实验流程(下图)的复杂性及实验周期较长,使得其结果的稳定性及准确性极易受到实验操作及批次的影响。基于传统IP这一大痛点,康测科技搭建了IP自动化实验平台,全面应用于多种IP相关的组学产品中,解决了IP项目生物学重复差,结果不可信的问题。最大程度杜绝了人为操作引入的误差,真实还原实验样品间的组学结果差异。同时,自动化平台拥有着极高的通量,可以同批次进行16个样品的IP实验,在兼容复杂实验方案上表现更为亮眼。
免疫沉淀自动化体系优势介绍
免疫沉淀自动化体系主要针对于实验中的孵育,多次洗涤,产物洗脱等过程全程采用自动化仪器执行。基于自动化的磁吸装置,以转移磁珠替代传统人工转移反应液的方式,避免操作差异对的IP效率的干扰。
免疫沉淀自动化平台
前面介绍了自动化的原理,接下来就跟随小编一起通过视频详细了解全套自动化IP反应流程吧~
免疫沉淀自动化平台下ChIP seq结果实例
以组蛋白ChIP seq为例展示了三个生物学重复样品在自动化IP平台体系下的分析结果:
1)ChIP seq富集信号在TSS上下游的分布模式在三个生物学重复中高度一致,符合组蛋白修饰分布特性;
2)具体靶标基因track上的富集信号在三个样品中重复性非常高;
3)使用IDR(Irreproducibility Discovery Rate)方法分析生物学重复之间的高重复性peak;
免疫沉淀自动化
联系我们
地址:武汉市江夏区东湖新技术开发区高新六路99号南山·光谷自贸港A栋6楼
邮箱:seqhealth@seqhealth.cn
电话:027-65527552
热门服务
关注康测公众号