scATAC-seq（Single-cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing）是bulk ATAC-seq的单细胞版本，其核心依然基于Tn5转座酶在细胞核内的染色质DNA上进行随机转座特性（如下图），同时结合微流控等技术实现了单细胞分辨率。

由于真核生物mRNA的5'端具有帽子结构，因此可以通过加帽位点来确定TSS。CAGE-seq(Cap analysis of geneexpression and deep Sequencing)可以通过识别加帽位点来对所有mRNA的TSS进行鉴定，传统的CAGE-seq建库流程较为复杂和繁琐，康测科技改良了传统CAGE-seq建库方式，推出UIDCAGE-seq，可以通过UID精准定量，获得更为准确的结果。

DAP-seq (DNA affinity purification sequencing)通过体蛋白表达技术获得带亲和标签的转录因子蛋白，与基因组DNA在体外结合并回收DNA，最后进行高通量测序和生信分析鉴定转录因子全基因组的结合位点。DAP-seq具有无需特异性抗体、物种适用范围广以及材料准备成本低等优势，特别适合大规模转录因子结合位点的研究。

由于CUT&RUN使用的MNase相比CUT&Tag的Tn5酶蛋白分子量更小，在蛋白结合的空间位阻层面上更有优势，分辨率相对更高，因此更适合转录因子（尤其是先驱转录因子）和抑制型组蛋白修饰（例：H3K27me3、H3K9me3等）的研究。作为康测科技表观基因组产品矩阵的补充，CUT&RUN以适用转录因子、高信噪比的优势，助力表观基因组调控新发现。