m6A meRIP-seq

 

m6A是最丰富的mRNA修饰,也是被研究的最清楚的RNA修饰。m6A修饰存在于mRNA、lincRNA、pri-miRNA和rRNA中。m6A修饰是一个可逆的过程,对m6A进行研究绕不开催化/擦除m6A修饰的修饰酶(Writers)...

m5C meRIP-seq

 

m5C修饰是最早发现的RNA修饰之一,最初研究表明主要分布在tRNA和rRNA上,近期研究表明,真核生物的mRNA上也存在m5C修饰,其可以维持mRNA的结构和稳定性、调控翻译过程等。

m5C bsRNA-seq

 

与DNA的BS-seq类似,bsRNA-seq利用重亚硫酸盐处理时,会发生脱氨基反应,最终从胞嘧啶(C)转换成尿嘧啶(U);如果胞嘧啶发生了m5C甲基化修饰,这个转换则无法发生,处理之后仍然是胞嘧啶...

ac4C acRIP-seq

 

DNA甲基化和去甲基化的动态平衡控制着生物体中基因表达的强度。甲基化可以改变DNA片段的活性,当位于基因启动子中时,DNA甲基化通常起到抑制基因转录的作用。在哺乳动物中,DNA甲基化对于正常发育...

m7G meRIP-seq

 

RNA上目前发现存在着170多种不同类型的转录后修饰,并且所有已知的RNA种类都可以被修饰,其中rRNA和tRNA的修饰最多。mRNA上的主要修饰类型包括m6A、m1A和m5C。m5C修饰是最早发现的RNA修饰之一....