转录因子ChIP-seq 

 

转录因子蛋白通常具有DNA结合结构域和功能结构域。根据DNA结合结构域的特征,转录因子可以被划分成数十个家族。通过识别增强子或启动子的相应序列结合到DNA上之后,转录因子可以通过多种方式行使对转录的调控功能...

RIP-seq 

 

RIP-seq(RNA immunoprecipitation and deep sequencing)是RNA免疫沉淀与高通量测序结合的技术,它通过免疫沉淀目标蛋白来捕获蛋白体内结合的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,可获得RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并对其结合强度进行精确定量...

DAP-seq 

 

DAP-seq(DNA affinity purification sequencing,DNA亲和纯化测序)属于类ChIP-seq的体外实验。它通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的TF,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出与TF结合的DNA,再使用高通量测序,找到TF的结合位点。

eCLIP-seq 

 

通过高通量研究RNA结合蛋白(RNA Binding protein,RBP)在体内与众多 RNA 靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示 RNA分子与RBP相互作用的革命性技术。.

LACE-seq

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