生信小课堂•用云平台绘制小提琴图

 
01 工具简介
 
小提琴图 (Violin Plot),用于展示多组数据分布状态以及概率密度,兼具箱形图和密度图的特征,不仅可以展示统计信息,还可以呈现数据的整体分布情况,适用于样本量较大、数据分布复杂的场景。其主体部分形似一组垂直排列的“小提琴”,一个“小提琴”代表一列数据或类别
 
图1 小提琴图要素
 
图2 文献中的小提琴图
 
02 康测科技小提琴云工具
 
1.页面模块化,功能划分简洁
 
从左往右依次为导航栏、使用指南、数据预览、参数设置和问题解答。
 
图3 工具初始界面
 
2.零代码操作,参数自由设置
 
(1)自由设置箱线宽度
 
在参数设置选项中,可一键调节箱型的宽度,按照需求,随意调整。
图4 不同宽度参数的小提琴图
 
(2)多种配色方案自由选择
 
小提琴图云工具提供多种配色方案,根据需求自由选择,操作简单一键换色。
 
图5 多种配色方案
图6 不同配色方案(左default,右futurama)
 
(3)支持添加/去除图中标题
 
可在右侧参数设置模块内输入各项标题,自由设置,可根据需要添加或去除图中标题。
 
图7 标题参数设置
图8 可选择添加各个标题
 
03 康测科技云分析平台试用
 
康测科技云分析平台整合超过100种组学分析工具,配备详细、精炼的讲解视频和工具文档,全程零代码、自主参数设置。如果您有使用需求,可私信小编,小编将给您发送试用账号~
 
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04 参考文献
 
1. Liyu Zhang, Meiling Zhang, Shuyu Huang, et al. A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabits the xylem sap in maize plants[J]. Nature Communications, 2022
 
2. Shiyuan Wang, Qi Zhang, Chunlu Yu, et al. Immune cell infiltration-based signature for prognosis and immunogenomic analysis in breast cancer[J]. Briefings in Bioinformatics, 2021
 
3. Daniel Haensel, Suoqin Jin, Peng Sun, et al. Defining Epidermal Basal Cell States during Skin Homeostasis and Wound Healing Using Single-Cell Transcriptomics[J]. Cell Reports, 2020
 

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关于康测

 

康测致力于先进组学技术的开发和在生物医学研究领域的应用,建立了涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、表观转录组学、免疫组学和互作组学的全面组学服务体系。而在医学检测方面,康测基于自主研发的SMP(Stranded Multiplex PCR)靶向测序技术,可提供检测灵敏度和特异性均为100%的MRD一站式自动化解决方案。
康测提供全面的基因表达调控研究工具
康测提供高度自动化MRD一站式解决方案

 

创建时间:2024-11-21