NAR IF16.6|武汉病毒研究所关武祥老师团队揭示ac4C修饰调节病毒RNA加工的分子机制
快速导读
【题目】N4-acetylcytidine coordinates with NP1 and CPSF5 to facilitate alternative RNA processing during the replication of minute virus of canines
【发表期刊】Nucleic Acids Research
【发表时间】2025年4月1日
【IF】16.6
【发表单位】中国科学院武汉病毒研究所
【康测科技提供技术】UMI RedaC:T-seq（ac4C化学法）
RNA修饰在RNA代谢、结构和功能中发挥重要作用。N4-乙酰胞苷（ac4C）修饰已被证明可以提高信使RNA和病毒RNA的稳定性和翻译效率。然而，ac4C与可变RNA加工之间的关系仍有待探索。
2025年4月1日，中国科学院武汉病毒研究所关武祥老师团队在Nucleic Acids Research（IF 16.6）上发表了题为“N4-acetylcytidine coordinates with NP1 and CPSF5 to facilitate alternative RNA processing during the replication of minute virus of canines”的研究文章，揭示了N-乙酰基转移酶10（NAT10）催化MVC（minute virus of canines）上ac4C修饰，调节病毒DNA复制和RNA加工（包括可变RNA剪接和多聚腺苷酸化）。通过acRIP-seq和RedaC:T-seq，研究鉴定并表征了功能性ac4C修饰的残基3311，其影响MVC RNA加工，而非改变病毒RNA稳定性。研究发现，nt 3311的ac4C修饰参与NP1介导的病毒RNA加工，而不影响NP1的RNA亲和力。同时，CPSF5可以与NP1相互作用并以ac4C依赖性方式介导病毒RNA加工。体外实验表明，NP1募集CPSF5到MVC RNA，ac4C修饰促进CPSF5与目标区域的特异性结合，从而保证精确的可变MVC RNA加工。研究不仅揭示了NAT10及其催化的ac4C修饰的功能，还阐明了RNA修饰协调MVC蛋白和宿主因子以实现高效病毒复制和可变RNA加工的机制。
研究思路
关键结果展示
康测科技为本研究提供UMI RedaC:T-seq（ac4C化学法）技术服务。前面的研究发现NAT10催化MVC RNA上ac4C修饰，并促进病毒复制。因此，需要进一步鉴定和表征MVC RNA上功能性ac4C修饰残基。通过从MVC感染的WRD细胞中提取纯化RNA并进行RedaC:T-seq以实现单碱基分辨率鉴定MVC RNA上ac4C位点。结果鉴定到7个潜在位点：nt432、3005、3311、3978、3988、4462和4477；其中，具有“CCG”基序的nt 3311和nt 3978也在acRIP-seq中被检测到；acRIP后qRT-PCR进一步证明，nt 3311突变降低了MVC RNA上ac4C修饰水平，说明nt 3311是MVC RNA上ac4C修饰位点。
参考文献
Xueyan Zhang, Shuangkang Qin, Fang Huang, et al. N4-acetylcytidine coordinates with NP1 and CPSF5 to facilitate alternative RNA processing during the replication of minute virus of canines[J]. Nucleic Acids Research, 2025
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