Adv. Sci.|四川大学华西医院&华西口腔医院发现液-液相分离形成的核冷凝物通过可变剪接调节线粒体自噬
【题目】 Nuclear Condensates of WW Domain-Containing Adaptor With Coiled-Coil Regulate Mitophagy via Alternative Splicing
【发表期刊】Advanced Science
【发表时间】2025年1月22日
【IF】14.3
【发表单位】四川大学华西医院&四川大学华西口腔医院
【康测科技提供技术】RIP-seq建库测序、RNA-seq
在真核细胞核复杂的环境中,存在一些由液-液相分离(LLPS)引发形成的无膜细胞器(MLOs)。核斑是pre-mRNA加工所必需的MLOs,不仅作为剪接因子的储存位点,还调节转录和mRNA成熟。含WW结构域的卷曲螺旋接头蛋白(WAC),包含N端的WW结构域和C端的卷曲螺旋(CC)结构域,是多种细胞功能的调节因子,包括组蛋白H2B泛素化和转录、有丝分裂进入等。WAC基因突变还会导致 DeSanto-Shinawi综合征。此外,WAC与SC35(核斑标记物)高度共定位。然而,WAC是否在调节pre-mRNA剪接中发挥作用尚不清楚。
2025年1月22日,四川大学华西口腔医院周陈晨和四川大学华西医院张祯威老师共同通讯在Advanced Science(IF 14.3)上发表了题为“Nuclear Condensates of WW Domain-Containing Adaptor With Coiled-Coil Regulate Mitophagy via Alternative Splicing”的研究文章,揭示了WAC在核斑中充当支架蛋白,经历LLPS形成生物分子冷凝物来调节pre-mRNA剪接的重要机制。研究表明,WAC通过C端CC结构域经历LLPS,形成生物分子冷凝物,并通过N端WW结构域定位于核斑。WAC充当支架蛋白,结合并诱导与RNA结合基序蛋白12(RBM12)的共相分离,后者可能与剪接体U5 snRNP组分相互作用,参与可变剪接的调节。破坏WAC介导的LLPS会导致线粒体自噬基因的剪接结果改变并影响线粒体稳态。研究为DeSanto-Shinawi综合征的发病机制提供了新的思路,并拓展对核冷凝物介导的可变剪接调节的理解。
康测科技为本研究提供RBM12 RIP-seq(部分)和RNA-seq技术服务。RIP-seq被用于鉴定RBM12蛋白结合的RNA,结果发现RBM12与U5 snRNA(剪接体的主要成分)结合,暗示RBM12可能调节可变剪接。RIP-qPCR进一步证实了RBM12与U5 snRNA的结合。而RNA-seq借助差异可变剪接事件(DASEs)分析发现WAC调节可变剪接,WAC缺乏会导致数以千计的mRNA改变。GO分析表明这些WAC调节的ASEs基因在“通过剪接体调节mRNA剪接”、“线粒体自噬的调节”、“细胞器定位的建立”等通路富集。并且,RNA-seq分析获得的ASEs基因经过RT-PCR得到证实。RNA-seq还用于检测敲低RBM12后可变剪接事件变化,进而证明RBM12参与可变剪接的调节。此外,GO分析表明WAC/RBM12调节可变剪接,进而影响线粒体自噬。
Jiahe Wang, Yi Fan, Guowen Luo, et al. Nuclear Condensates of WW Domain-Containing Adaptor With Coiled-Coil Regulate Mitophagy via Alternative Splicing[J]. Advanced Science, 2025



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